在法国大革命期间，法令宣布该建筑物归属公共财产。1833年，它成了一位热衷于中世纪艺术的收藏家亚力山大·度索美拉安置他的收藏品和居住的地方。在他去世之后，国家买下他的收藏品和公馆。
1842年，克卢尼国立中世纪博物馆举行了开幕仪式。展品反映了古代高卢罗马时代到中世纪法国的社会生活 ：有服装、金银器皿、挂毯、彩画玻璃和木雕等。其中最引人瞩目的是21个犹太国王的头像，在法国大革命期间被革命者错当法国历代国王而打落。

古罗马克卢尼温泉浴堂建于公元三世纪，正常运转一个世纪之久。 后来由于航海者商会与敌交战被烧毁。现存的遗址中，还能清楚地分辨出三个洗浴厅：冷水浴厅，温水浴厅和热水浴厅。其中冷水浴厅里托架交叉拱穹柱子上刻着当时强大的航海者商会船首的象微，情形保藏良好。

建于中世纪末的克卢尼公馆背靠古罗马温泉浴堂遗址，是哥特式火焰风格建筑的典范。它是法国极为稀少的保存至今的民用建筑。公馆前有别致的庭院和草坪花园，建 筑物由正屋和两旁侧翼组成，中世纪惯用的防御性齿形和墙角塔，在这里却变成为装饰手段。公馆的窗子中梃很高，数量很多，预示了“文艺复兴时期”休闲别墅风格的到来。